課程資訊
課程名稱
遺傳流行病學原理
Principle of Genetic Epidemiology 
開課學期
111-1 
授課對象
學程  生物統計學程  
授課教師
陳為堅 
課號
EPM7138 
課程識別碼
849 M0330 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四3,4(10:20~12:10) 
上課地點
公衛212 
備註
與蕭朱杏、郭柏秀、林菀俞合授
總人數上限:45人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程係以對數量遺傳分析有興趣之研究生為主要授課對象。課程內容以介紹各種常用之遺傳流行病學概念為主,解釋其涵義。開始時先介紹孟德爾遺傳定律、Hardy-Weinberg平衡、基因頻率的估計、聯鎖不平衡與半形頻率的估計、機率與遺傳危險性的計算等基礎概念。然後介紹幾種與基因定位有關的設計原理,包括聯鎖現象及其在基因拼圖上的應用、量性性狀的遺傳模式、再現率與基因型相對風險、Lod Score方法與聯鎖分析、基因體連鎖掃瞄、家庭為基礎之關聯分析。另外,有一些新的領域也做一些簡介,包含遺傳分析的貝氏統計、基因隨機漂流與歸宗、與基因表現量之分析等議題。至於這些概念在各種遺傳流病分析上的實際應用,不在本課程內教授;這些內容會在「基因體數量分析」中介紹。
 

課程目標
本課程的目標在於介紹關於質化與量化性狀遺傳分析的基本原理 ,讓學生瞭解如何透過遺傳分析蒐尋疾病的易感基因,以奠定他們進一步探討遺傳流病之文獻的基礎,有助於銜接其他之遺傳流行病學課程。 
課程要求
授課方式為課堂講授,並建議多種參考書。此外會分發補充讀物。成績評估包括:作業 (約5次, 50%) 和期末報告 (50%)。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
每次上課前,會將補充讀物置於課程網頁。 
參考書目
1. Griffiths AJF, Wessler SR, Lewontin RC, Carroll SB (2008): Introduction to
Genetic Analysis. 9th Ed. New York, W. H. Freeman and Company.
2. Thomas DC (2004): Statistical Methods in Genetic Epidemiology. New York:
Oxford University Press.
3. Hartl DL, Clark AG (2007): Principles of Population Genetics. Fourth Ed.
Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates.
4. 財團法人陳拱北預防醫學基金會(2015)。公共衛生學(修訂五版)。台北市: 國立臺灣大學出版中心。 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
作業 
50% 
約5次 
2. 
期末報告 
50% 
先在期末課堂上口頭報告,之後交書面報告 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/8  a. Course introduction, overview of genetic epidemiology
b. 遺傳流行病學 (陳為堅,2015) (公共衛生學-中冊第20章,修訂五版。台北市: 國立臺灣大學出版中心; 2015:167-202) 
第2週
9/15  Mendelian inheritance and its extensions/陳為堅 
第3週
9/22  Hardy-Weinberg equilibrium and estimation of gene frequency/陳為堅  
第4週
9/29  Linkage disequilibrium and estimation of haplotype frequency/陳為堅 
第5週
10/6  Genetic risks and kinship coefficient/陳為堅 
第6週
10/13  Genetic linkage, recombination fraction, and mapping function/陳為堅 
第7週
10/20  a. Genetic model for quantitative traits/陳為堅
b. Recurrence risk ratio and genotype relative risk/陳為堅 
第8週
10/27  Linkage analysis for categorical and quantitative traits/陳為堅 (期中考週) 
第9週
11/3  Analysis for gene expression levels and gene dosage effect/陳為堅  
第10週
11/10  Guest Lecture: Bayesian approach to genetic association studies/蕭朱杏 
第11週
11/17  Guest Lecture: Application of GWAS in genetic dissection of complex diseases/郭柏秀 
第12週
11/24  Random genetic drift/陳為堅 
第13週
12/1  Hand-On Practice: Genetic Risk demo/TA 
第14週
12/8  Guest Lecture: Genetic analysis to incorporate both common and rare variants/林菀俞 
第15週
12/15  Guest Lecture: Precision Oncology/陳璿宇 
第16週
12/22  Students' Presentation (期末考週)